Acyclovir memiliki efek samping meningkatkan serum bilirubin dan enzim liver, perubahan yang berkaitan dengan darah, kulit kemerahan, demam, sakit kepala, pusing, gangguan pencernaan, hepatitis, penyakit kuning, angioedema (pembengkakkan pada jaringan bawah kulit), gangguan saraf reversibel, rambut rontok, rasa menyengat, terbakar, gatal.