Cara aplikasi atau cara pakai pupuk TON NASA dilakukan sebelum pengapuran, caranya kolam dikeringkan terlebih dahulu setelah TON NASA diaplikasikan kemudian kolam dikapur dengan kapur dolomit dengan dosis 1 ton kapur dolomit / Ha ( 100 kg / 1000 m ) atau sesuai PH aktual dibiarkan selama 3 hari, kemudian kolam diisi air kurang lebih 10 cm dan di biarkan selam 7 - 10 hari, biarkan TON NASA bekerja baru kemudian kolam diisi air secukupnya dan dibiarkan 3 hari sebelum kolam disebar bibit. sesudah masa pembesaran penggunaan TON NASA dilakukan 15 hari sekali cukup 500 gram perkolam.